然而让周蜜万万没想到的是，在这个节骨眼上，她的右腿受伤了，准确地说她患上了“髌骨软骨软化症”。随着病情加重，她的右腿根本使不上力。在训练的时候，受右腿影响，她原本可以一步上前的动作，却得拖着右腿小跑上前，这对训练影响很大。
就在周蜜一边治疗一边不肯停下训练的时候，李永波再次找到她，表示已经安排把她调整回省队。显然，李永波的意思是强迫她退役。而她虽然从没有放弃过追逐世界冠军的梦想，却从来没有一次敢于和教练对抗。所以当李永波说要她回省队时，尽管这个消息对她打击很大，她却还是听从了安排，选择了退役。
退役后，周蜜先是四处访医问药，最终功夫不负有心人，她的伤病在名医的治疗下得到了康复。看到自己的右腿又恢复如初，周蜜兴奋不已，这意味着她又能打羽毛球了。
不过，此时的周蜜已经退役，说得不好听一点，就连个基本的训练环境都没有了。考虑到自己几乎一年多的时候都没有训练，为了能尽快恢复当初的实力，周蜜需要找一个理想的地方训练。
当时，李矛正好在马来西亚做教练，他得知周蜜想找一个地方训练后，就邀请周蜜到马来西亚去做陪练。周蜜欣然前往并在李矛的指导下开始训练。

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然而，周蜜还没训练多久，国内就纷纷传闻她加入了马来西亚，很有可能代表马来西亚参加世锦赛或出任球队教练。关于周蜜的传言，李永波在接受采访人员采访时，也表示非常生气，他认为周蜜是国家培养出来的老队员，不应该做出这种有损国家利益的事情来。
眼看舆论闹得越来越凶，周蜜只得放弃在国外训练的想法，同时她还在新浪等网站声明，她的出走只是私人性的活动。而她也不会更改国籍，并表示她接下来准备去读书。
2006年，香港特区政府为了吸纳各行各业的人才，推出了“优才计划”。显然，这个计划对已经退役却并不愿意放下羽毛球拍的周蜜来说，是个相当不错的出路。也就是说，以她的实力，只要加入香港球队阵营，她将再次复出，并再次在世界上闪亮登场，最终实现世界冠军的梦想。而这也不需要付出改变国籍的代价。
其实在这之前，荷兰和马来西亚都曾许以优厚的待遇邀请过周蜜，但周蜜只想为中国打球，所以她拒绝了这些国家的邀请。最终在香港队的盛邀下，周蜜通过“优才计划”，成为了香港队的实力战将。
由于一年多没有参赛，周蜜的世界排名已经清零，想要重新登上世界排名第一的高位，她需要从最初级的比赛打起。尽管有些浪费时间，但周蜜还是坚持了下来，通过不断的比赛，她的实力也越来越强，最终她在2008年再次取得了辉煌的成绩，在世界公开赛上先后夺得了8枚金牌，并在世界羽联超级系列赛总决赛上获得了女单冠军，从而再次排名世界第一，也成为了中国队的强劲对手。
但是对于2008年的北京奥运会，周蜜虽然做好了比赛准备，可最终由于没有特区护照，未能取得比赛资格。
尽管无缘奥运，但在接下来的一年里，周蜜在超级赛和公开赛上获得了多枚奖牌。
可惜的是，周密再次遭遇坎坷，2010年8月，周密因兴奋剂呈阳性受到国际羽联宣布禁赛2年的处罚。
尽管周蜜一再坚持，她只是在新加坡羽毛球公开赛时，因为感冒吃过几盒感冒药，但这并不能改变国际羽联的处罚决定。而这个处罚对已经32岁的周蜜来说，表明她已经赶不上2012年的伦敦奥运会了。同时由于伤病和年龄的原因，周密最终只能选择退役了。